Protein–RNA interactions for Protein: Q8N668

COMMD1, COMM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD1Q8N668 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms