Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
P3H3Q8IVL6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
P3H3Q8IVL6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
P3H3Q8IVL6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
P3H3Q8IVL6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
P3H3Q8IVL6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
P3H3Q8IVL6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
P3H3Q8IVL6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
P3H3Q8IVL6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms