Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms