Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms