Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CHIC1Q5VXU3 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CHIC1Q5VXU3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CHIC1Q5VXU3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CHIC1Q5VXU3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CHIC1Q5VXU3 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms