Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT6Q5T7P8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT6Q5T7P8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms