Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms