Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms