Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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