Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B3Q16720 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
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