Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms