Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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GABRA6Q16445 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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GABRA6Q16445 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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GABRA6Q16445 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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GABRA6Q16445 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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GABRA6Q16445 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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GABRA6Q16445 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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