Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USF2Q15853 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USF2Q15853 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USF2Q15853 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USF2Q15853 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF2Q15853 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF2Q15853 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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