Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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PCM1Q15154 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PCM1Q15154 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PCM1Q15154 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PCM1Q15154 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCM1Q15154 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PCM1Q15154 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCM1Q15154 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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PCM1Q15154 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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PCM1Q15154 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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PCM1Q15154 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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PCM1Q15154 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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