Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms