Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
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