Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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