Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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