Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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