Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME3Q13232 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME3Q13232 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME3Q13232 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NME3Q13232 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME3Q13232 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME3Q13232 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME3Q13232 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME3Q13232 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME3Q13232 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME3Q13232 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME3Q13232 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME3Q13232 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME3Q13232 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NME3Q13232 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NME3Q13232 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NME3Q13232 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NME3Q13232 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NME3Q13232 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME3Q13232 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME3Q13232 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME3Q13232 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME3Q13232 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME3Q13232 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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NME3Q13232 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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NME3Q13232 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME3Q13232 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME3Q13232 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME3Q13232 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME3Q13232 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME3Q13232 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME3Q13232 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME3Q13232 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME3Q13232 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME3Q13232 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME3Q13232 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME3Q13232 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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