Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
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