Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms