Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms