Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms