Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms