Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms