Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN8P56748 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms