Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
ATP5EP56381 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ATP5EP56381 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ATP5EP56381 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ATP5EP56381 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ATP5EP56381 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ATP5EP56381 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ATP5EP56381 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ATP5EP56381 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ATP5EP56381 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ATP5EP56381 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ATP5EP56381 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ATP5EP56381 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ATP5EP56381 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ATP5EP56381 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ATP5EP56381 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms