Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPT1P50897 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPT1P50897 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPT1P50897 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPT1P50897 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPT1P50897 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPT1P50897 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPT1P50897 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPT1P50897 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPT1P50897 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPT1P50897 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPT1P50897 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPT1P50897 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPT1P50897 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms