Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms