Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms