Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms