Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ALDH4A1P30038 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALDH4A1P30038 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms