Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD34P28906 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD34P28906 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD34P28906 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD34P28906 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD34P28906 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD34P28906 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD34P28906 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD34P28906 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD34P28906 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD34P28906 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD34P28906 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD34P28906 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms