Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms