Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBB3P26998 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms