Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms