Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCLP18206 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCLP18206 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCLP18206 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCLP18206 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCLP18206 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCLP18206 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCLP18206 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCLP18206 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCLP18206 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCLP18206 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCLP18206 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCLP18206 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCLP18206 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCLP18206 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VCLP18206 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms