Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms