Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms