Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms