Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms