Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DYSFO75923 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DYSFO75923 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DYSFO75923 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DYSFO75923 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DYSFO75923 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DYSFO75923 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DYSFO75923 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DYSFO75923 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DYSFO75923 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DYSFO75923 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DYSFO75923 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DYSFO75923 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DYSFO75923 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DYSFO75923 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DYSFO75923 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DYSFO75923 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DYSFO75923 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DYSFO75923 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DYSFO75923 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DYSFO75923 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DYSFO75923 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DYSFO75923 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DYSFO75923 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms