Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMFO60524 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMFO60524 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMFO60524 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMFO60524 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMFO60524 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMFO60524 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMFO60524 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMFO60524 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMFO60524 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMFO60524 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMFO60524 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMFO60524 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMFO60524 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMFO60524 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEMFO60524 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEMFO60524 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEMFO60524 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEMFO60524 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEMFO60524 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEMFO60524 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEMFO60524 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEMFO60524 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMFO60524 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMFO60524 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMFO60524 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMFO60524 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMFO60524 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMFO60524 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMFO60524 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMFO60524 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMFO60524 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMFO60524 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMFO60524 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMFO60524 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMFO60524 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMFO60524 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMFO60524 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMFO60524 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMFO60524 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMFO60524 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMFO60524 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMFO60524 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms