Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms