Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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