Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms