Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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TRBV30A0A0K0K1B3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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