Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SF3B2-201ENST00000322535 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RASGRP4-218ENST00000617966 2927 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC8A1-209ENST00000408028 2898 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CFB-271ENST00000425368 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DGKZP1-201ENST00000378718 2776 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DEPDC5-202ENST00000382112 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MAPK10-252ENST00000640970 2620 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RYR1-201ENST00000355481 15377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KANK1-205ENST00000382297 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PKD1L2-203ENST00000525539 7379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MYO5A-205ENST00000399231 12225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LILRB2-204ENST00000391749 2286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 HADHAP2-201ENST00000540341 2285 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GREB1L-209ENST00000580732 8749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MYO1F-201ENST00000338257 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP6C-202ENST00000415905 4172 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC90B-214ENST00000529689 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NCMAP-201ENST00000374392 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ERBB3-201ENST00000267101 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 POU6F2-207ENST00000518318 5925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC31A-228ENST00000509142 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF3D-203ENST00000405442 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CAMSAP2-202ENST00000358823 7352 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LIMCH1-219ENST00000514096 3543 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CBFA2T2-210ENST00000543126 3502 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 HHAT-208ENST00000545154 3507 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DAB1-206ENST00000414851 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 HHAT-206ENST00000537898 3446 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GULP1-201ENST00000359135 3347 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CTNNA2-219ENST00000629316 3167 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SRGAP2-217ENST00000624873 4705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 BRD4-203ENST00000371835 4624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 OR6C66P-203ENST00000641469 4627 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FN1-203ENST00000354785 8905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 IL21R-202ENST00000395754 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TNS2-204ENST00000546602 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CLIP1-201ENST00000302528 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FPGT-TNNI3K-206ENST00000557284 2855 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EMB-201ENST00000303221 4281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AAGAB-201ENST00000261880 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF15-201ENST00000361926 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF423-207ENST00000567169 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CNIH4-202ENST00000366857 3963 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DCLRE1B-201ENST00000369563 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TRBV7-6-201ENST00000390374 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GNAI2P2-201ENST00000417003 916 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.3 ms