Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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